Kebanyakan orang yang mengunjungi Taman Botani Jindai tidak tahu kalau ada bagian taman yang terpisah yang memiliki kebun tanaman air dan juga reruntuhan sebuah kastil kuno. Bagian taman ini terletak di depan Kuil Jindaiji, bukan di belakangnya - di sisi seberang dari jalan utama.
Aliran air di sekitar kuil mengalir ke kebun ini dan menciptakan rawa yang dipenuhi dengan bunga iris, alang-alang, dan tanaman sawah. Di atas rawa terdapat jalan setapak melewati hutan, ladang yang ditanami soba, dan lapangan berumput luas yang sangat cocok untuk piknik.
Bagian utama dari Taman Botani Jindai dibuka pada tahun 1961, sedangkan kebun tanaman air ini dibuka pada tahun 1985. Di area rawa kebun tanaman air ini terdapat serangga, burung dan satwa liar lainnya. Air rawa bersih dan jernih, menjadikannya rumah bagi sejumlah kura-kura.
Waktu terbaik mengunjungi Taman ini adalah akhir bulan Mei sampai pertengahan bulan Juni saat bunga-bunga iris sedang mekar penuh. Anda dapat masuk ke kebun tanaman air yang merupakan bagian terpisah yang rahasia dari Taman Botani Jindai ini secara gratis.
