Terhitung dari 1 Juli 2016, Hongkong Airlines akan meluncurkan layanan langsung dua kali sehari antara Hongkong dan Bandara Narita, Tokyo. Penerbangan akan berangkat dari Hongkong pada pukul 09.15 dan 15.30 waktu Hongkong, dengan penerbangan balik dari Narita pukul 09.30 dan 15.55 waktu Jepang.
Rute baru Tokyo akan beroperasi dengan pesawat terbang A330 Airbus, dengan kabin kelas bisnis dengan 32 kursi. Sebagai penerbangan pelayanan penuh, penumpang dapat menikmati kenyamanan perjalanan dengan bagasi bebas biaya sampai 20 kg,
Dilengkapi dengan penerbangan 2 kali sehari ke Okinawa, penerbangan tiap hari ke Okayama, lima kali layanan mingguan ke Sapporo, tiga kali seminggu layanan ke Kagoshima, penerbangan dua kali seminggu ke Miyazaki dan Kumamoto, Hongkong Airlines akan beroperasi dengan total 47 penerbangan dalam seminggu antara Hongkong dan Jepang.